Монастырский комплекс стоит на высоком холме недалеко от деревни Ванк. По легенде, в этой горе было найдено множество серебряных рудников, оттого и церковь на ней стали звать Гандзасар – «гора сокровищ».
Построенный в XIII веке монастырь действует и сейчас. Причем самой значимой церковью Арцаха он был с самой даты своего основания. По версии средневекового историка Мовсеса Каганкатваци, именно здесь хранится важнейшая христианская святыня – голова Иоанна Крестителя. В некоторых редакциях труда Каганкатваци есть целая глава «О честной голове Иоанна Крестителя, о том, как она была доставлена в гавар Арцах и помещена в святом Гандзасаре...», где он подробно рассказывает о всех перипетиях святой головы. Главная церковь – Святого Иоанна Крестителя – напоминает архитектурные шедевры древней армянской столицы Ани – города тысячи и одного храма. Здание украшено множеством барельефов, среди которых фигура основателя Гандзасара князя Гасан-Джалал Дола, который держит в руке макет церкви.
Наряду с древними барельефами на одной из монастырских стен можно увидеть очень современную деталь – снаряд времен Карабахской войны, вонзившийся в каменную кладку, но так и не взорвавшийся.